Las referencias se utilizan para colocar un personaje, objeto u objeto de atrezo en una escena. Un objeto puede tener múltiples referencias, en un misma escena o en distintas escenas. Cada referencia tiene sus propias condiciones, que indican cuando el elemento referenciado está presente en la escena. Cuando las condiciones de una referencia se cumple o están activas (o siempre si la referencia no tiene condiciones) el elemento aparecerá en la escena. La posición en la escena y la escala también dependen de la referencia y no del elemento referenciado, por lo cual, cualquier elemento puede aparecer varias veces en la misma escena pero en distintas posiciones y con escalas diferentes.
Las referencias utilizan un sistema de capas para el pintado. Éstas se pintarán en el orden indicado por las capas.
Esto quiere decir que, cuando hay más de una referencia, aquella en la capa X quedará delante de las que estén en las capas Y, donde Y X, y detrás de las que estén en las capas Z, donde Z > X. El sistema de capas da gran flexibilidad para la creación de escenas, permitiendo que sea el creador del juego quien decida cuando se pintará cada uno de los elementos.